拜师礼简单而庄重。没有宾客盈门，没有繁文缛节，只在刘家清静的小院中，于刘智亲手所书、悬挂于书斋的“医者本心”四字横幅下，周远、李墨、赵垣三人，身着整洁的布衣，依次向端坐椅中、面容清癯的刘智行三跪九叩大礼，奉上清茶。刘智一一接过，轻啜一口，算作认下。晓月作为师母，也受了礼，给每人备了一份文房四宝作为见面礼。礼成，刘智再次重申入门三规，三人肃然应诺。记名弟子孙文亦在一旁观礼，神色复杂，有羡慕，有失落，也有一份被认可指点机会的珍惜。
入门，仅仅是开始。刘智对三名正式弟子教导之严、要求之高，远超他们最初的想象。这不仅体现在医术的传授上，更贯穿于日常言行、心性品格的时时砥砺。
刘智并未因身体孱弱而放松要求，反而因精力有限，更加注重“质”而非“量”。他并未立刻传授高深医理或独门秘方，而是从最基础的功夫抓起。
每日清晨，天色未明，三人便需来到刘家小院。第一件事，不是读书，而是劳作——打扫庭院，整理药圃，处理炮制一些简单药材。刘智要求他们必须亲手去做，不得假手他人。“医者，先需知药。不知药之生长、采摘、炮制，如何知其性味功效？手脚不勤，如何体察细微？心不静，如何洞察病机？” 刘智的声音总是平静，却带着不容置疑的力量。周远年纪小，起初觉得枯燥，但见师兄李墨、赵垣皆一丝不苟，也只得收敛心思，认真去做。日复一日，在清扫落叶、侍弄草药的过程中，最初的浮躁渐渐沉淀。
劳作之后，是晨读。刘智指定了《黄帝内经》的篇章，要求他们反复诵读，直至烂熟于心，然后静坐冥思，写下自己的理解，哪怕只是一字一句的体会。“读经不在多，在精，在悟。囫囵吞枣，不如细嚼慢咽。经文如镜，照见的是你们自己的心性与悟性。” 每日的功课，刘智都会亲自检阅，不只看他们写了什么，更看他们如何思考，有无新见，有无谬误。对于死记硬背、泛泛而谈者，他会以问题引导，步步紧逼，直至对方冷汗涔涔，意识到自己的浅薄；对于稍有见地者，他也不会轻易褒奖，而是指出其中可能存在的疏漏，或引导其向更深层次思考。
午后，是刘智讲解医理、分析病例的时间。他不再像著书时那般系统阐述，而是常常针对某个具体的理论难点，或是一个真实（或模拟）的疑难病例，让三人各抒己见，互相辩驳。他很少直接给出答案，更像一个冷静的引导者和裁判，在三人争论得面红耳赤、理屈词穷时，才会以寥寥数语点出关键，或提出
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