丹汗崛起后，因支持林丹汗对抗后金，最终在 1635 年被后金征服。
（四）漠北蒙古：远离中原的 “草原孤岛”
漠北蒙古又称 “外喀尔喀”，是达延汗时期喀尔喀万户北迁后的产物，主要由七部组成，以杭爱山、克鲁伦河为中心，覆盖今蒙古国大部分地区。
16 世纪中期，外喀尔喀七部分为三大领主势力：
左翼由达延汗幼子格哷森札札赉尔的长子阿什海达尔罕统领，
右翼由次子诺颜泰哈坦巴图尔统领，中翼由三子乌巴岱彻辰统领，彼此保持着松散的联盟关系。
由于远离中原，外喀尔喀与明朝的直接冲突较少，主要通过漠南蒙古间接获取中原物资。但该地区面临着来自西部卫拉特蒙古与北部沙俄的双重压力。
16 世纪后期，卫拉特蒙古的准噶尔部开始向漠北扩张，与外喀尔喀发生多次战争；
17 世纪初，沙俄势力侵入贝加尔湖地区，迫使外喀尔喀的布里亚特部臣服。在这种困境下，外喀尔喀各部一方面加强内部联合，另一方面寻求藏传佛教的支持，邀请西藏喇嘛到漠北传教，逐步形成了 “政教合一” 的统治模式。
布里亚特蒙古作为漠北蒙古的 “边缘部落”，世代居住于贝加尔湖以东的森林地区，被称为 “林中百姓”，以狩猎与游牧为生。
17 世纪 30 年代，沙俄哥萨克骑兵侵入布里亚特草原，通过修建堡垒、强迫纳税等方式进行殖民统治。
布里亚特部曾多次反抗沙俄入侵，并向漠北喀尔喀部求援，但因喀尔喀部自身难保，最终在 1654 年被沙俄彻底征服，成为俄罗斯布里亚特共和国的前身。
（五）漠西卫拉特蒙古：西迁与分裂中的挣扎
漠西卫拉特蒙古即明朝前期的瓦剌，15 世纪后期瓦剌衰落後，逐步西迁至阿尔泰山以西及新疆北部地区，形成准噶尔、和硕特、杜尔伯特、土尔扈特四大部，此外还有辉特部等小部落，合称 “卫拉特四部联盟”。
四部联盟设有 “丘尔干”（议会），由各部首领共同商议重大事务，但始终未能形成统一的集权统治。
准噶尔部是卫拉特四部中崛起最快的部落，16 世纪后期以新疆伊犁为中心，逐步兼并周边部落。
其首领哈喇忽剌凭借强大的军事力量，成为卫拉特联盟的实际掌控者，积极向天山以南的维吾尔族地区扩张，为后来准噶尔汗国的建立奠定了基础。
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