主体架构的底层逻辑，则是按照三省六部的考量而来。
其实在东汉中后期的时候，以尚书台为核心的中央政权內部已经出现了后来三省六部的雏形，只是隨后的演变还需要好几百年才能完成。
而刘基觉得就不用浪费这几百年了，一步到位，让其他军阀好好看看什么叫制度优势。
正儿八经的三省六部制度有一整套办事的规章流程，特別是三省，决策、封驳、执行的分工是很明確的，也很科学，有道理。
但是很可惜的是，受限於皇朝体制和皇帝这个大bug的存在，这套相互制衡的权力模式从未真正贯彻过，或者只在某些短时期內层花一现过。
只不过刘基觉得，在现在这种大爭之世中搞出这么复杂细致的流程是很没有效率的行为。
他一个割据军阀要什么程序正义？
打天下也能慢工出细活？
打天下要的就是快！
直接上手办事就完了。
所以他直接省略了三省，直接规划六部一吏部，礼部，户部，工部，刑部，兵部。
为了更加契合时代，他选择了这个时期更加大眾化的“曹”作为部门的称谓，而具体的责任划分也不能死板的按照传统六部来。
比如他一个割据军阀要什么正儿八经的礼部？
打天下的时候还要一板一眼的按照孔老夫子的那套周礼来？
除此之外，负责管理军事的兵部当然是需要的，管理官吏选拔升迁的吏部也是需要的，管理財政的户部或者说是民部也是需要的，管理工程建设的工部和管理法律执行的刑部也是需要的。
於是刘基决定在政事堂之下设五部，或者说，五曹。
兵曹。
吏曹。
民曹。
工曹。
律曹。
至於相对应的职权，他也有考量。