神都森林深处，矗立在山谷中的大量的古老墓碑的附近，黑色的巨人正在游荡，它是抓握宝可梦“黑夜魔灵”！
忽然，它聆听到了灵界的电波，那边正在呼唤着，说就在刚才附近有人死去，让自己赶快去把灵魂带回灵界。
但不一会，灵界的电波又出现了另外的指示——不用去了，人复活了。
黑夜魔灵：“.？”
身为幽灵宝可梦以及灵界公务员的黑夜魔灵，很清楚一件事——人死不能复生，除非变成幽灵宝可梦，那么复活是个什么意思？
黑夜魔灵搞不明白，它游荡在墓地之中，最终停留在一座白色的石碑前面。
石碑上面写着它看不懂的古代文字，而石碑里面，有着一道沉睡的灵魂。
上面究竟写了什么，那个灵魂究竟要怎么样才肯醒过来与自己回归灵界，说起来这些白色的石头究竟是什么，为什么能够让灵魂停留其中？
那些文字，究竟是留给谁的？
神都附近的天空中，通体深蓝色，有着四只巨大铁爪的钢铁宝可梦正如飞碟一样在附近的天空中盘旋。
有着浅蓝色短发，西装革履的年轻人正按照光苔发送的地址进行寻找，终于，他在天空上向下俯瞰的时候，隐隐约约见到了一片村落，以及，坐落在村落较远处的一座孤零零的工坊，下面隐约有着人影。
“没错，按照烟墨市给出的路线图，应该就是那里了！巨金怪，落下去吧！”