天敌。
在地球进入新生代地质时期后，古敦等两个物种也从地球上消失，残存的一部分都在地底沉眠。初代古敦从沉眠中苏醒后，在奥多摩的第2采石场出现，遭到MAT队（怪兽特别攻击队）的战斗机攻击，但毫发无损。
在准备使用MN炸弹时，乡秀树发现了初代古敦附近有没能及时撤离的小孩，因此没有发射MN炸弹，初代古敦趁机潜回了地底离开。过后的一段时间里，初代古敦一直在地底四处活动，引发多起局部地区的地震现象。
当初代双尾怪在东京新宿的化石蛋里孵化出世后，初代古敦被初代双尾怪的气味吸引而来，两大怪兽齐聚东京。此时的双尾怪正在和杰克奥特曼作战，初代古敦将杰克当作是怪兽双方共同的敌人，也对杰克展开进攻。杰克虽仍继续奋战，但面对两只怪兽的攻势，最终因能量不足而战败，消失在夕阳下。杰克消失后，初代古敦转而攻击初代双尾怪，双尾怪逃往海中，古敦追赶而去。
不久后，初代古敦在梦之岛上出现，MAT队赶往迎战，用MN炸弹轰炸初代古敦，但怪兽毫发无伤，并逃回了地底潜藏。为了彻底消灭初代古敦等两头怪兽，MAT顶着巨大的压力和无数人的希望，研究出战法，拉开阵线准备最后一战。数天后，初代双尾怪在东京湾第4填筑地出现，初代古敦也被吸引而来。
MAT开始作战，乡秀树也变身为杰克奥特曼登场，与两只怪兽周旋。一开始，初代古敦继续和双尾怪暂时联手，一起攻击杰克；但由于MAT队的战法和火力援助，初代双尾怪的双眼被炸瞎，失去方向感的到处乱撞，误伤了初代古敦，愤怒的初代古敦反击双尾怪，一通猛烈的撕咬和投摔后，活活打死了初代双尾怪。两只怪兽去其一，剩下初代古敦独立对战杰克奥特曼。初代古敦被杰克以猛烈的格斗术压制，在遭到数次踢击和投摔后失去了反抗能力，最终被杰克的「斯派修姆光线」消灭。
那一次的战斗也算是杰克第一战败了。
毕竟不清楚这些怪兽的习性。
在弄清楚这帮家伙是天敌的关系之后，杰克就好打了很多。
不过杰克消灭的只是出现的，后续还有很多在地底下的怪兽，不过这些家伙不出来捣乱的话人类也不会去打扰它们的生活。
毕竟古敦和双尾怪还有泰莱斯通只要不是被影响了的话基本上不会到地面来惹事。
不过让人意想不到的是它们居然在地下给地球做了些好事情。
可能它们也没想到居然会有小零食
…。。