元军在折损大半兵力后退回海滩依托回回炮防守，由于伤亡惨重，再加上箭支和给养都即将用尽，无力继续守住阵地的元军只得上船撤退。
如果当时元军能在大琉球岛和釜山港设立后勤基地的话，那么他们就会得到充足的补给，战争的进程或许就会被改变。
值得一提的是，在返回高丽的路上元军的舰队遭到了风暴的袭击，虽然损失了一些船只，但不过大部分船只安全脱险，不像第二次东征时的运气那么差，搞得差一整个船队覆没。
松浦太郎等了几天，可博多湾的明军船只只是在海面上游荡，并没有进攻登陆的意思。
与此同时，接到松浦太郎的征召后，九州岛的大名们纷纷聚集了手下的军队、武士以及民壮，纷纷赶来博多湾进行防备，阻止明军登陆。
因为有着两次成功抵御蒙元军队东征的历史，故而九州岛的那些大名们来的时候非常轻松，认为如果明军想要登陆的话他们这次也能打败明军，丝毫也没有意识到危险的临近。
他们忘记了，十几年前李云天就成功地在萨摩藩的出水港登陆，进而击败了拥有最强海上力量的萨摩藩，使得萨摩藩逐渐衰败了下来。