锦衣卫北镇抚司镇抚使马顺亲自审理，李云天和王振奉御命督审。
其实，李清正的案子非常简单，不过是国子监彝伦堂前的古木树枝太过茂盛到了修剪的时候，否则就影响到了监生们的学习，故而李清正就让人剪掉了过多的枝节，然后把那些剪掉的树枝拿回家当柴烧，毕竟古代做饭还是用的柴木。
至于李清正在国子监违法乱纪的事情，虽然王振费尽心机进行查找可依然一无所获，要知道李清正这个清流领袖可不是徒有虚名的，首先就是清廉，否则也不会把那些废枝节拿回家当柴烧了，不要京城里的那些部院堂官，就是稍微有儿权势的官都不屑如此做。
虽然此次李清正的案子是马顺审理，但李云天作为督审提出了许多建议，而这些建议对审案有着重要的推动作用。
例如，李云天请来了皇家园林的工匠，这些工匠在树木花卉的培植上有着丰富的经验，以此来判断国子监彝伦堂的那些百年古木需不需要修剪。
如果换做锦衣卫北镇抚司的人来审案的话肯定不会想到这一，而且他们也不会这样做，很显然这样的话将给李清正开脱。
对此王振也感到有些无奈，归根结底他这次对李清正下手的理由太过牵强，如果细究的话根本就站不住脚，因此他也不准备拿这件事情去整死李清正，否则就是对文官集团明目张胆的挑衅了。
事到如今王振对李清正一案的发展非常满意，李清正不仅戴枷在国子监示众三天，而且还逼得文官集团和勋贵集团不得不联手来对付他，实际上他已经达到了整治李清正的效果，向外界展示出了实力。
经过李清正的案子后，王振的势力无疑会得到迅猛的发展，京城中那些一心想要往上爬的官员在见识到了王振有着与文官集团、勋贵集团相抗衡的力量后肯定会投靠他，这样一来内廷的势力将得以发展壮大。
而且，王振现在正在积极地拉拢朝廷的官员并且利用司礼监批红的特殊权力在朝廷各大部院衙门安插亲信。
由于李清正所犯的案子案情实在是太过简单，以致于仅仅用了短短一上午马顺就审完了案子。
根据皇家园林工匠以及国子监杂役、监生、老师等人的证言，马顺判决李清正命人裁剪古木茂盛枝节的行为是为了国子监正常的教学秩序，李清正身为国子监祭酒这样做并无不妥。
只不过，李清正不应该将那些剪下来的树枝带回家中作为柴薪，这使得外界对此极其容易产生误解，认为其以此谋私。
故而，
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