下，哈密王兀纳失里担心城破，因此遂遣使纳贡，平息了此次战火。
不过，兀纳失里凭着哈密国占有重要的地理位置，想要掌控西域诸国去明朝的使者和商人以垄断贡利，控制明朝与西域诸国的贸易，进而激怒了洪武帝。
于是洪武二十四年，洪武帝令左军都督府都督佥事刘真、宋晟率兵征讨，大破兀纳失里于哈密城，使得兀纳失里趁着夜色落荒而逃。
次年，藏匿于天山的兀纳失里派出使臣向洪武帝请罪，并进贡骡马若干匹，哈密正式归属明朝。
兀纳失里病死后，经洪武帝御准其弟安克帖木儿继任哈密国国王，继续遣使朝贡并以马市易。
永乐帝继位后，将哈密看成是大明与西域诸国往来的要塞，因此对哈密采取羁縻政策。
永乐二年，安克贴木儿被永乐帝封为忠顺王，并颁赐金印。
次年，安克贴木儿薨，因为安克贴木儿无子，因此哈密国官吏请大明将兀纳失里之子脱脱送还袭封忠顺王。
脱脱自幼长于京师，被永乐帝所抚养，因此永乐帝让脱脱回了哈密国，成为哈密国新一代的忠顺王，
第二年，也就是永乐四年，永乐帝在哈密设立了哈密卫，任命哈密贵族马哈麻火者为指挥使，又派汉人周安出任忠顺王府长史，刘行任王府纪善，协助忠顺王脱脱治理哈密国，由此可见对哈密国的重视。
哈密卫属于羁縻卫建置，类似于自治，享有很大的自主权利：
1，税收上，大明不收取哈密卫的赋税，哈密卫的赋税均交给忠顺王府；
，吏治上，哈密卫的各级官员绝大多数由当地的贵族担任；
，律法上，哈密卫的百姓犯法通常交由哈密本地衙门处理，朝廷一般不干涉；
4，军事上，大明没有往哈密派遣军队，地方上的部队由忠顺王府统辖。
虽然马哈麻火者是哈密卫的指挥使，但哈密卫的最高军政长官是忠顺王，而历任忠顺王要想继位必须要得到大明朝廷的认可。
哈密卫的设立表明大明对西域的重视程度日增，此后西域诸国和内地来往的使节、商队都要在哈密城办理各种手续。
永乐八年，脱脱薨，由于脱脱儿子卜答失里年纪尚幼难以继承王位，因此永乐帝于是封脱脱的从弟兔力帖木儿为忠义王，赐给了印诰和玉带等物，并且提升都指挥同知哈刺哈纳为都督佥事。
永乐十七年，因为兔力帖木儿尽忠职守，永乐帝特意派使臣来哈密慰劳，赐给
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