商毅想来想去，还是觉待不灭尚可喜，要比灭了他好。因此人马虽然进入广东境内，但并没有向尚可喜动进攻，其实就是给尚可喜一个暗示，就算尚可喜不派人来讲和，商毅也想动用在广州的情报网络，向尚可喜传达这个信息。总算尚可喜也还算机灵，派人来讲和了，这也正是商毅所希望的。
其实商毅的条件并不苛刻，根本不用尚可喜进贡什么，朱以海等人也一个不要，因此尚可喜也松了一口气，原来商毅是个很好说话的人啊，只有这样的要求，实在是太简单了，自己干嘛老是要和他过不去呢？清廷真是害死人了。
几天之后，尚可喜将张煌言、张名振、朱大典、张国维、熊汝霖等人从狱里放出来，并且再三向他们道歉赔罪。同时又以朱以海的名议下诏，也是通告整个南方，永安朝廷并不存在奸邪之徒，尚可喜过去虽是清军，但业已去清返明，改邪归正了，因此过去的事情就不用再提了。而关押张煌言等人，纯属误会，內部矛盾，尚可喜己经将他们释放，并且赔罪，同时也免去尚可喜的太师称号，但仍保留永宁王的爵位。并且也感谢商毅兵来调理永安朝廷内部的矛盾。但现自己己经解决了，因此请商毅回师。而最后，永安朝廷也表示承认商毅靖北王的称号。
而商毅也表示永安朝廷的矛盾己经解决，自己也将立刻撤军，但又再次提出，请朱以海到南京去继位。永安朝廷的答复是去南京继位，关系重大，不能轻易决定，因此派出张煌言、尚之言两人为使，到南京去和商毅商谈俱体的事宜，然后再做决定。
张煌言等人对这样的结果当然都不满意，他们希望的是商毅领军杀进广州来，把尚可喜灭掉，把朱以海接到南京去。但现在的决定权在商毅手里，他不愿动手，谁也没有办法。而且不管怎么样，这次自己能够脱离牢狱之灾，也确实多亏了商毅出兵。有了这一次教训，尚可喜大慨也会老实一点。
而对于永安朝廷决定派张煌言、尚之言为使，到南京去和商毅面谈，张煌言也觉得还有机会，自己到了南京，可以当面劝说商毅，因此也没有反对。
其实商毅根本没打算接皇帝到南京来，官员来才是他需要的，而商毅真正的目地，是想招开一个四方会谈，协商制定出一个处理南方各朝廷之间的公约秩序，这样不仅对南明三朝有一定的约束力，而且自己出兵打那一方，也有条约依据，并不是以下犯上。
现永安朝廷这一边总算是搞定了，商毅又向绍武、永历这两个朝廷再次去文书，仍然是请他们去南京继位，如
…。。