在随后的三天时间里，商毅也下令商家军，向驻守在南京城里的清军发动了连续的进攻。大文学
而这时清军在南京城里的驻守兵力只有四万左右，在兵力上己经不占多少优势，但火器部队大半都留在了南京，由其是火铳兵，还有近万人，另外还有火炮百余门。因为在此前的战斗中，商家军一直都是保持守势，而这一次商家军却主动进攻过来，因此阿济格也觉得，这个机会也十分难得，到是可以和商家军一战。从前几天的经验来看，和商家军的作战，最好的办法还是以火器来对付火器，现在自己也有足够的火器部队了，应该可以和商家军展开正面战斗。
在经过十几天的反复拉距之后，南京中部城区的建筑己被催毁了大半，只剩一间间残辕断壁，依稀还保留着几分城市的格局，另外还有好几处街道的大火未灭。街道上满是碎瓦残砺，而且百姓的尸体也随处可见。
这一战商家军出动的是李定国的第九师，兵力为一万左右，而清军也出动了一万二千人，包括有五千火铳兵、和二千弓箭手。两方的兵力大致相当，但因为是在城市中作战，中重型火炮难以定位瞄准，不过在九师的炮兵团中，有两个炮兵营无法参战，因此实际的兵力只有八千五百人，比清军要少一些。
在李定国下令进攻之后，八师的两个步兵团立刻分散成以营为单位，向前突进，而每个营又是以二个连为一组，一个连突前，一个连稍后掩护，并伺机使用小型火炮支援，这样一共分为十六个小队，展开面几乎覆盖了整个中部城区。虽然这时城区基本都被催毁，但在废墟中仍然可以找到许多掩体，因此各营在突进的过程中，各自寻找掩体掩护自己，然后依次前进。大文学
商毅在鼓楼上看得十分清楚，清军是以火铳兵、弓箭兵和其他士兵合作成纵队，从街道上向前推进。不过现在清军的主导思想依然还是逼近商家军之后，进行近身的作战，火铳兵和弓箭手只是为其他士兵提供火力掩护，最终还是依靠近战来结束战斗，因此并没有像商家军那样依赖于掩护。但还是将兵力分散展开，向商家军这边逼近过来。
不过经过十几天的城市战之后，清军也积累了不少巷战的经验，知道在城市中作战，不能将兵力扎推，而是要尽力将兵力展开，才能发挥自己在兵力上的优势，另外厚重的盔甲也影响了士兵们的灵活性，因此清军的弓箭手和火铳兵也都换上了轻便的皮甲，只有长枪兵还穿着厚甲，以便在接身作战的时候取得优势。至少和十几天以前相比，清军的巷战水平确实有了不小的进
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