穆陵关原先设计容纳的人口数量。不过现在是非常时期，也只能尽量挤压地方。好在现在是隆冬季节，不易滋生疾病。同时山东的冬季，雨雪也不多，因此还是能度过去的。
于是商毅将人口进行了一次整理，按四十户为一个小组，以一户为小组长，付责管理整个小组；又以五个小组为一个大组，指定五个小组长中的一个为大组长，付责管理整个大组，分别登记造册。于是全城的居民共分为四十七个小组，九个大组，以后无论是分配食物、物资、住所，还是调动劳力，都将以小大组为单位。不仅方便，也便提高效率。
而现在穆陵关储备的物资有：粮食一万两千五百八十石，面粉一千七百五十石。白银有六万二千四百两，黄金一千三百六十两，其他的布料、木材、牛皮、棉花、食盐等物资，牛、猪、羊、狗、鸡、鸭等牲蓄家禽也都各有若干。
现在最重要的物资就是粮食，商毅估计了一下，目前关里的粮食差不多能够支付五到六个月，应该够坚持到这一次清军撤军。由于现在穆陵关的粮食是执行统一分配制，因此商毅也制定出毎人毎天的口粮标准，在正常情况下：士兵一天的口粮为一斤，青壮年妇女的口粮为十二两，老人为和十至十四的少年均为十两，十岁以下的儿童为八两。而到了战争的时候，则根据实际情况，另行补助。
同时商毅又对居民做出了三点规定，一、严禁打架斗殴，偷盗抢劫，一经发现，立刻逐出关去，决不轻饶。二、每天的饭食和饮用热水都由各组组长带领人手，统一到伙堂领取，各窝棚的居民的用火必须在露天指定地点进行，绝对严禁在家中点火，以防造成火灾，一但发现，处罚当天的饭食减半。三、禁止随地大小便，毎户都发给一个便桶，并指定位置倾倒，如果发现有人随地大小便，处罚每天收集便桶，清理粪便的工作。
同时商毅又组织了一支监察队，由少年队的士兵组成，每天就在城里巡察，抓到违返规定的人，立即进行处罚，并向全城公布。
另外穆陵关里的军用物资有：马三百二十七匹，生铁五千三百斤，配置好的火药一千四百斤，另有三千五百斤木炭，八百斤硝和一千三百斤硫磺。
军器方面，有铁甲两千八百四十五套，皮甲一千三百七十四套，绵甲八百七十八套，长弓四百三十八把，短弓二百一十六把，箭三万五千支，盾牌一千二百面，刀枪器械六千七面余件。
火器方面，有虎蹲炮八门，小型佛郎机炮四门，中型佛郎机炮三门。鸟铳三百0二支，其中有一百四十四
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