分别抽调精兵（他要告诉所有士兵，他对所有人都是一视同仁，完全信任每一个士兵的忠诚。果然，当他从英武军和降军中各选拔了五百人作为亲卫后，所有将士都对这种用人不疑的作法感到钦佩，每一个人都决定要用行动向刘璋誓死效忠），将亲卫营由五百扩充到两千人，以典韦、许褚为亲卫营校尉；另将骑兵全部划入亲卫营，八百骑兵从属于典韦、许褚，由周仓具体负责指挥。
英武军编制不变，仍有六千四百人（缺额从降军中补充），以满宠为将军，魏延为副（兼任一营校尉），任命戏志才、逢纪为正副参军。全军整编为三个营，每营四部两千人，余者四百编为英武军亲卫营（不是满宠的亲卫，刘璋此举是要强调军队的真正归属），亲卫营由张任指挥（骑兵划入亲卫后，张任作为一帅才，若再做护卫，为免太浪费了，刘璋便将他放到英武军中）。除魏延外，又任廖化、李严分别另两营之校尉。
整编后的东州军共有一万一千人（与英武军一样，缺额从降中中补充），编为五营，每营四部两千人，另设东州军亲卫营，编制为一千人。东州军以严颜为将军、徐晃为副（兼任一营校尉），任命郭嘉、毛玠为正副参军，五营分别以黄忠、张辽、管亥、梁习为校尉，亲卫营以裴元绍为校尉；
余下两千六百人暂编为补充营（士兵多为两战下来的轻伤员和体质较差的士兵），补充营由侯成为校尉，龚都从旁相助，补充营并无作战任务，但是训练量却丝毫不减，一旦作战部队战损后，便由补充营补充。而以后再有俘虏，一律不编入作战部队，再在补充营进行整训。