将亚当的胚胎和量产机融合的原因还要从古代说起。新世纪福音战士的故事其实从远古时期就开始了，那个时候地球上还并没有这些巨大生物。
直到一颗陨石坠落在了地球之上，坠落的位置是南极，而陨石则带来了亚当，天生就拥有着生命果实。亚当又生下了17个使徒，他们也都各自携带有生命果实。
而后又一颗陨石坠落在了地球之上，那颗陨石之中是莉莉丝，他拥有的则是智慧果实，她并没有生下孩子，但坠落之后身体内流出的鲜血淌满了海洋，而正是这片鲜血海洋之中孕育出来了地球上的众多生命。
因此，不只是人类，地球生态圈中绝大多数的物种都蕴含着智慧果实的碎片。
而当智慧果时与生命果实相互结合的时候，就足以诞生出堪比神明的存在。只不过单个人的智慧果实相比于使徒和亚当的生命果实来说，实在是太微量了，并不足以成神，因此人类在尝试在南极进行实践，将人类的基因注入到亚当体内的时候，并没有创造出一个神明，而是引发了第二次冲击。
如今将亚当的胚胎融入到量产机之中，其实也是在进行类似的行为。亚当的胚胎之中有最大的一块生命果实，而之前的战斗中就已经证明了，在量产机体内的傀儡系统中，有绫波丽的克隆体，而里面蕴含着的，则是莉莉丝的一部分灵魂。
剧场版之中，碇真嗣能够触发第三次冲击，就是因为那个时候的初号机已经凑齐了S2机关，自身是亚当身体的一部分，而他要救出来的正是绫波丽的灵魂，三者组合在一起，恰好就引发了第三次冲击。
而即便是三者并没有完全凑齐，当智慧果实与生命果实结合在一起之后，依旧可以获得无比强大的力量。
量产机的体内本来就有量产版的S2机关，虽然不足以完成补完，但也足以为这强大的力量提供足够的能源。
莉莉丝的残骸旁，五台量产机围绕成一个五角星的形状，看起来仿佛是在进行什么神秘的宗教仪式一般，而他们则依次将手掌伸入了自己的体内，从体内掏出了自己的S2机关，随后将他们全部都送到了中央的一台并没有被启动的特制量产机的体内。
这台机体比起另外几台量产机明显高出一头，身材也显得更加粗壮，五个S2机关同时塞进他的体内，也不会显得臃肿。
而随着这台机体获得能源，淡金色的光环在他的头顶一闪而逝，但很快就像是信号不好一样，闪烁了两下，又消失掉了，随后一股无形的力场将整个地下世界笼
…。。