也不允许散乱。还没有退回曹军大本营，于禁路上发现十多个衣衫不整的伤兵，一问之下，原来是青州兵在打家劫舍。
青州兵原是黄巾贼，后来投降了曹操，仍称青州兵。
曹操对他们很宽容，因此他们经常放肆，乘机抢劫。
于禁一听，便追讨这些也是自己人的青州兵。
有些青州兵不敌，逃回曹营打小报告，诬告于禁造反，杀自己人。
有人劝于禁首先向曹操处报备，但于禁说，“如今贼兵就在后面追赶，我首先抗敌；至于曹公，他是明智的人，正是谣言止于智者，怕什么？”
于是，于禁先筑好了濠沟以防敌人进攻，然后才令人通知曹操及向他解释。
曹操听了，认为于禁的做法很对，当众说，“当时敌人来攻，相当混乱，于禁能在混乱中整顿军队，追讨抢掠的恶行，安营筑寨地坚守，真是好将领的榜样。”
于是，录于禁前后功，封为益寿亭侯。
建安三年(198年)，于禁又和曹操破张绣于穰，擒吕布于下邳（pī）。
官渡之战，袁绍兵盛，于禁愿意担任先登。曹操称赞于禁，于是遣步卒二千人由于禁统领，守延津以拒袁绍，曹操引军还官渡。
刘备在徐州刺史杀车胄以自立，曹操亲自率军前往攻打。
田丰建议袁绍立刻进攻曹操的后方，袁绍则因为儿子生病而否定了田丰的计划。但袁绍依然派出了一部分军队攻延津，于禁坚守延津，袁绍的军队不能攻下。
后来，于禁与乐进等将领率步骑五千，渡河，攻击袁绍别营，从延津西南缘河至汲、获嘉二县，焚烧保聚三十馀屯，斩首数千，俘获数千，招降袁绍将何茂、王摩等二十余人。
曹操派于禁单独领兵进驻原武，攻击袁绍在杜氏津的营寨，破之。迁裨将军，后从还官渡。曹操与袁绍连营，起土山相对。
袁绍命令士兵向曹操的营中射箭，曹操的士卒多死伤，士兵惧怕。于禁督守土山，力战激励士气。官渡之战后，于禁迁偏将军。
建安七年(202年)，刘表派刘备北伐袭击许都，一直打到了叶县，已逼近许昌，曹操调动大将夏侯惇（dū
）、于禁、李典抵抗刘备，刘备将阵线后撤至博望与曹军对峙。后来，于禁带兵接应李典，刘备自觉强攻无益，于是被迫撤退，曹军成功保卫了许都。
建安十一年(206年)，昌豨投降曹操后再次反叛，曹操派遣于禁征讨。
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