癫狂、邪祟侵扰及寻常医药难效的疑难杂症，同时严守不妄治、不贪财、不用术害人的铁律，是医理与玄术相融的独特治病法门。
江湖上关于祝由科的传说数不胜数：相传，清同光年间有位手酮道人，行道三十年，仅凭符咒祝祷救治无数人，一次为权贵爱姬治下部毒疮，因触犯“男女授受不亲”的戒律，险些毁去毕生功力；还有位祝由师在黄河边遇到一具浮尸，用“还魂咒”配合符水，竟让死者回光返照，交代完后事才咽气，传为奇谈。
从现代医学的角度看，祝由科其实是古代的“心身医学”——符咒、咒诀和仪式、器都是心理暗示的载体和情绪疏导的过程，通过“移精变气”调节患者身心状态，激活自愈系统，尤其对心因性疾病，比如癫狂、失眠、癔症的效果显著。但它终究不是万能的，不能替代药物与手术，这也是江湖祝由师坚守“不妄治”铁律的根本原因。