原著一样，没有投靠任何的忍村之下，之前漩涡一族和木叶是非常要好的盟友，并且初代火影和漩涡一族的族长的女儿还进行了联姻，之后随着初代火影的死后二代火影一直想将漩涡一族纳入木叶的统治之下，但是遭到了漩涡一族的反对，随后联盟的关系逐渐破裂。
在失去木叶保护的漩涡一族没有看清自己，他们认为他们拥有强大的封印术和强大的查克拉可以在这世界有着一席之地，但是他们不善于打仗，他们的忍术很薄弱，但是他们又拥有其它人羡慕的封印术等许多宝贝，匹夫无罪，怀璧其罪。于是漩涡一族就这样被其它的忍村联合消灭了，瓜分了他的“宝藏”。
由于木叶已经与漩涡一族不是盟友的关系，且木叶与各大忍村签订了互不侵犯条约所以没有办法直接出手帮助。