而在民间传说当中，杨祖师是在一日晚间交代完后事后，半夜消失，后来弟子四处寻找，在灵山绝顶找到了他，却是站在悬崖边直立而寂。
不管怎么寂的吧，总之就是弟子遵照他的指示，将遗蜕移入龛中，经七日后，其弟子启龛视之，但见满面红光，宛然如生。
杨祖师生前交代，若自己的肉身七日不腐，则可将自己肉身移置佛堂，长期供奉，能完全干固，不再腐朽。
其后果真如此，而事情传出后，灵山寺名声大噪，杨祖师被尊为“肉身佛”，一时间香火鼎盛至极，无数善信不远千里万里而来，只求拜倒佛前，得到庇佑。
“杨祖师肉身佛像直到解放都一直妥善存于龛中，每年几次大法会之际会由寺内僧人开启龛门，供信众们瞻仰。”周至给大家介绍起这神奇的事件：“后来在特殊时期寺庙衰败，有两个毛贼认为可以盗窃寺宝卖钱，竟然将杨祖师的肉身偷走，到山下才被抓住。”
“大家认为杨祖师肉身是个麻烦，便将之火化了，改以塔葬。”
“不过这并不影响灵山寺直到现在都是整个凉山州最重要的寺庙之一。”