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天祐元年正月，朱温遣心腹牙将寇彦卿奉表入长安，逼迫昭宗即刻东迁。昭宗明知此去便是囚笼，却无力反抗，只得率百官、后宫，含泪离京。汴军士卒奉命拆毁长安宫室、百官衙署乃至百姓民居，取下木材，浮渭水而下运往洛阳，昔日繁华帝都，一朝化为丘墟瓦砾，满目疮痍。长安百姓扶老携幼，被迫东行，一路号哭不绝，人人痛骂：“贼臣朱温，倾覆社稷，使我等流离至此，天必诛之！”
车驾行至华州，沿途百姓夹道跪拜，齐呼万岁。昭宗闻声，止泪摇手，凄然道：“百姓勿呼万岁，朕已不复为汝主矣！”
当夜宿于兴德宫，昭宗对何皇后垂泪叹道：“俗谚云纥干山头冻杀雀，何不飞去生处乐，朕今漂泊四方，生死不由己，不知最终葬身何处啊。”言罢，君臣后宫，相对而泣，彻夜不绝。
行至陕州，昭宗欲以何皇后新产皇子、不便上路为由，拖延行期，伺机密诏四方藩镇勤王。朱温得知，怒不可遏，急令寇彦卿：“速促官家东来，一刻不得迟延！再有拖延，便自行处置，不必回报！”
闰四月，昭宗被迫入洛阳，入宫之日，左右侍从尽数被汴军替换。昭宗身边旧日小黄门、内园小儿二百余人，全被朱温诱出灌醉，尽数缢杀，另选身形相貌相似者顶替。昭宗起初未察，数日后方知真相，自此心惊胆战，终日噤若寒蝉，形同囚虏，连一言一行都在朱温严密监视之下。
朱温既将天子牢牢控制在洛阳，便开始以皇帝诏令号令天下：贬逐忠于唐室的旧臣，封赏自己的亲信将吏；河东李克用、凤翔李茂贞、西川王建等藩镇，虽联名传檄天下，声讨朱温专权，却各怀私心，互相观望，无一敢真正出兵与朱温决战。
朱温又在大梁设立元帅府，以敬翔为元帅府判官，李振为谋主，天下藩镇任免、朝政赏罚、钱粮兵甲，一切大事皆出自大梁元帅府，长安、洛阳朝廷，不过徒具文书，盖章画诺而已，毫无实权可言。
一日，蒋玄晖自洛阳连夜赶回大梁，入府密报朱温：“天子虽居深宫，日夜悲泣，仍暗写绢诏，用蜡丸封藏，由宫人潜出，传檄四方藩镇，召天下勤王兵马，欲图主公。”
朱温听罢，按剑猛地站起身，目露凶光，杀气四溢，声如寒铁：“李唐余孽，死不悔改！留此天子，终是祸根！我今挟天子以令诸侯，天下谁敢不从？他日便当行禅代大事，取李唐而代之，有敢阻我者，尽皆诛灭！”
言毕，朱温即刻传令，命朱友恭、氏叔琮率重兵严守洛阳宫禁，断绝内外交通，任
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