这是朝廷“掺沙子”、加强控制的策略，但权衡利弊，得到实利且地位提升，远比固守原址、时刻面临未来可能的猜忌要好，遂欣然应允，并再次提出联姻之请，态度更为恳切。
杨博起依旧以皇帝年幼婉拒，但赏赐加倍，并暗示待皇帝年长，或可再议。
苏泰虽略失望，但也知此事急不得，有了实际利益，联盟已然稳固。
第三步，也是最为关键的一步——设立“辽东将军府”。
杨博起以“辽东地域辽阔，女真、蒙古诸部杂处，边情复杂，需统合军政，方足以镇抚”为由，上《请设辽东将军府疏》。
他在疏中详细阐述了将军府的职能：总辖辽东都司各卫所边军，兼理安抚女真诸卫，督办屯田、互市，推广教化，整饬边备。
将军位高权重，有临机专断、先斩后奏之权，但需定期向朝廷述职，且重大人事钱粮仍需兵部户部核备。
此议在朝中引起激烈争论。
反对者认为这是变相设立藩镇，易尾大不掉。支持者则认为辽东情况特殊，非设重臣不足以镇抚。
最终，在太后力主下，小皇帝朱文盛下旨，准设“辽东将军府”，驻地辽阳。
至于首任将军人选，朝中争议更大。
杨博起自知以宦官之身不可能久镇外藩，且东南、京师皆需他坐镇，故而主动上疏，以“才疏德薄，且需还朝侍奉陛下、太后”为由，坚辞不就，并推荐了数名人选。
最终，在杨博起暗中运作与太后支持下，一个折中方案出台：调任漠北都护府裴骁前往辽东，暂摄“辽东将军”事，但同时，朝廷派遣一名文官重臣担任“辽东巡抚”，与裴骁同理军政，互相制衡。
杨博起将其麾下大将厉寒锋留任辽东，加授“辽东将军府赞画军事兼掌侦缉事”，实际负责监控女真各部、稽查不法，并拥有一支直属于将军府的精锐侦缉力量。
沈问心、公孙班也被暂时留下，协助整顿辽东武备、营造。阿敏、叶赫那拉·苏泰等女真首领，皆受辽东将军府节制。
除此之外，杨博起还招募流民、安置降卒，在辽河平原及边墙附近大兴屯田，分发农具种子，减免赋税，鼓励耕种。引导部分归顺女真部落学习农耕，渐离游牧。
杨博起还让人严格管控“五市”，将交易品类、数量、价格制度化，严禁走私违禁物品。设立官牙，公平交易，抽取税赋用于地方建设与抚赏。
他在辽阳、开原等地设立“蒙学”，允许并鼓励
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