第二阶段训练，如勒布朗所说，完全不同。
如果说第一阶段是把知识塞进脑子里，第二阶段就是把知识融进身体里，刻到骨头上。
训练内容是一样的：射击、格斗、战术、爆破、通讯……但方式变了。不再是教官讲解、学员练习，而是高强度、高频率、高压力的重复训练。
射击训练：不再是固定靶，是移动中的射击，是不同姿势快速转换的射击，是在体力耗尽后的射击。他们要在全速奔跑四百米后立即卧倒射击，要在格斗训练后手抖的情况下****并射击，要在水下憋气一分钟后浮出水面立即瞄准。
格斗训练：对练不再戴护具（除了要害部位），教官鼓励“适度真实受伤”。齐梓明的肋骨断了一根——在和阿列克谢的对练中，但他没有报告，只是自己简单固定，继续训练。三天后，断骨自我愈合，虽然疼痛，但可以忍受。
战术训练：不再是小队行动，是排级、连级模拟。他们学习指挥更大规模的单位，学习协同不同兵种（虽然只是模拟），学习处理复杂的战场信息流。
穿插在各种训练之间的，是场景模拟对战。这些模拟不再是考核性质的，而是训练性质的，但更真实、更复杂。
有一次模拟是城市人质解救。他们扮演突击队，要在限定时间内攻入一栋被“****”占领的建筑，解救“人质”。但情报有限，“****”数量不明，人质位置不明，而且有倒计时——如果超时，“****”会处决人质。
齐梓明作为突击队长，必须在极短时间内制定计划。他决定分两组：一组正面佯攻，吸引注意力；二组从屋顶索降突入。行动中，他们遇到了没有预料到的情况：建筑内有大量非战斗人员（模拟平民），需要区分敌我；一个“****”挟持了人质，要求谈判；而且时间比预计的更紧张。
最终他们成功了，但损失了两人（模拟），解救了大部分人质。任务结束后，教官进行了长达两小时的复盘，指出每一个决策的优缺点，每一个战术动作的改进空间。
“在真实战场上，没有完美行动。”教官说，“只有不断接近完美的过程。复盘不是为了批评，是为了学习。”
另一次模拟是野外遭遇战。他们在森林中行军，突然遭到伏击。没有预警，没有准备，完全突然。齐梓明的第一反应是寻找掩体，同时指挥还击。但伏击者使用了***和震撼弹，制造混乱。他们被迫分散，各自为战。
那场模拟持续了三小时。三小时里，
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