崇祯帝定下北军、南军改革的基调后，众人也分配到了各自的任务：兵备司负责火器的打造，兵部负责阵亡将士、受伤将士的抚恤、改革的方略等，内承运库提供钱粮支持，商务部负责税收扶持，“军统”、“中统”负责监督各方，尚书台负责各方协调。
“内阁也不要闲着，西北剿匪的事情要盯死了，督促洪承畴歼敌务尽，决不能让流贼折腾没完！”
众人各自领到任务，随即陈新甲问道：“陛下，北军、南军伤亡将士的抚恤，是按照兵部惯例，还是陛下圣裁？”
崇祯帝说道：“此战的抚恤就不要考虑惯例了，阵亡士兵抚恤白银五十两、粮食两百石，朝廷供养家眷十年；受伤将士抚恤白银三十两、粮食一百石，受伤至残者，朝廷供养终身。各级将佐的抚恤按级别逐级增加，具体兵部酌情拟定。另外，伤亡将士的子嗣如愿意参军，可优先入北军各营。”
“遵旨。”
一旁的徐元英则微微皱眉，按照崇祯帝定下的标准，光是抚恤一项，朝廷就要花费七十万两银子以上、两百数十万石粮食，这还不算赏功花费的。
“还有赏功的标准。”
崇祯帝说道：“北军、南军全体赏赐十两功勋银，有功将士按照斩首数量，建奴首级五十两，蒙古首级三十两，汉军首级二十两，建奴各级首领酌情定数。”
“遵旨。”
“另外，两日之后，朕要在午门外，为阵亡将士举办国葬，具体细节，兵部和礼部商议。”
“再通知工部，在京西妙峰山找一处风水宝地，修建忠烈祠，用于供奉大明阵亡将士、忠臣义士的牌位。”
两日后，崇祯帝一身素衣站在午门城墙上，偌大的午门广场上人山人海，京城内的百姓，北军、南军的有功将士，以及伤亡将士的家眷，早早的来到这里，众人神情悲怆，在寒风中看向午门城楼。
此时的城楼上，悬挂了若干缅怀阵亡将士的挽联，礼部的官员高声宣读着祭奠文章，以及朝廷抚恤伤亡将士的旨意，特别是崇祯帝下旨在妙峰山修建忠烈祠的旨意，极大的安抚了伤亡将士家眷心中的悲痛。
接着，在礼部官员的安排下，午门外数百人开始吟唱屈原的《国殇》：
“操吴戈兮被犀甲，车错毂兮短兵接。旌蔽日兮敌若云，矢交坠兮士争先。凌余阵兮躐余行，左骖殪兮右刃伤。霾两轮兮絷四马，援玉枹兮击鸣鼓。天时怼兮威灵怒，严杀尽兮弃原野。出不入兮往不反，平原忽兮路超远。带长剑兮挟秦
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