杨广得知陈叔宝被擒，建康城破，大喜过望，即刻率大军入城，占据建康宫城。随后，杨广下令，查封陈朝府库，收缴金银珠宝，又下令安抚建康百姓：“隋军入城，只为伐罪吊民，严禁烧杀抢掠，凡敢违抗军令者，斩立决！”
建康百姓起初惶恐不安，见隋军纪律严明，秋毫无犯，心中渐渐安定下来。而那施文庆、沈客卿等奸佞之臣，皆被隋军擒获，押至杨广面前。
“施文庆、沈客卿，你二人祸乱朝纲，残害百姓，致使陈朝灭亡，可知罪？”杨广坐在大殿之上，厉声呵斥。
施文庆跪地求饶：“殿下饶命！臣只是奉命行事，一切皆是陈叔宝之意，与臣无关啊！”
沈客卿也连连磕头：“殿下，臣罪该万死，求殿下开恩，饶臣一命！”
杨广冷笑一声：“你二人作恶多端，百姓早已怨声载道，今日若饶了你等，何以平民愤？来人，将施文庆、沈客卿斩首示众，以儆效尤！”
二人被拖出殿外，斩首示众，建康百姓见之，皆拍手称快，纷纷说道：“这些奸贼终于死了，真是大快人心！”
祯明三年正月，陈朝灭亡，自陈霸先开国，传五帝，历三十三年，终为隋所灭。杨坚得知建康城破，陈叔宝被擒，大喜，下令将陈叔宝及其宗室、百官迁往长安，又下令废除陈朝苛政，安抚江南百姓，江南之地，尽归大隋版图。
那陈叔宝被迁往长安后，杨坚念其昏庸无能，无甚威胁，封其为长城县公，赐宅居住。陈叔宝依旧不改荒淫本性，每日饮酒作乐，醉生梦死，竟在长安活了十余年，直至仁寿四年病逝，终年五十二岁。而那首《玉树后庭花》，也成了亡国之音的代名词，流传千古，警示后人。