不能承担治理国家的重任，天下还不稳定，需要年长有能力的君主来镇守。我想效仿周公、霍光的做法，废掉现在的皇帝，自己登基，大家觉得怎么样？”
王晏第一个站出来附和：“令公功劳卓著，深得民心，应该顺应天意和民心，登基称帝！”
徐孝嗣也说：“令公是皇族的长辈，又有废掉昏君、拥立明君的功劳，登基称帝是名正言顺的！”
萧鸾非常高兴，于是以太后的名义，废掉萧昭文的帝号，改称为海陵王，把他迁出皇宫，住在别的宫殿里。几天后，萧鸾派人送毒酒到海陵王的住处，萧昭文哭着说：“我希望生生世世，再也不要生在帝王家！”说完就喝下毒酒死了，年仅十五岁。
十月二十二日，萧鸾在建康南郊举行登基大典，改年号为建武，史称齐明帝。明帝登基后，追尊自己的父亲萧道生为景皇，母亲江氏为懿后，把自己的儿子们都封为王，任用萧遥光、萧遥欣、萧遥昌（都是他哥哥的儿子）作为心腹，掌控朝政大权。
明帝心里很清楚，自己是皇族的旁支，通过篡位当上皇帝的，高帝、武帝的子孙还有很多，他们都手握兵权，将来一定会成为自己的隐患，于是就有了杀掉这些皇族的想法。
建武二年（495年），明帝召萧遥光进入内殿，秘密商量：“高帝有七个儿子，除了我之外，都已经成年；武帝有二十多个儿子，也大多被封为王，镇守各地。这些人将来一定会威胁到我，我想把他们都除掉，以绝后患，你觉得怎么样？”
萧遥光躬身回答：“陛下英明！高帝、武帝的子孙们遍布各地，手握兵权，确实是隐患。应该分批杀掉他们，先杀近亲，再杀远亲，不留任何祸根！”
明帝点头：“就按你说的办。先杀掉高帝的儿子河东王萧铉、临贺王萧子岳等人，再杀掉武帝的儿子晋安王萧子懋、随王萧子隆等人。”
命令下达后，萧铉、萧子岳等人都被赐死，他们的家属也受到牵连被杀。随后，明帝又派军队围攻担任江州刺史的晋安王萧子懋、担任荆州刺史的随王萧子隆，萧子懋、萧子隆兵败被杀，他们的亲信也都被诛杀。
建武三年（496年），明帝又杀掉了高帝的儿子湘东王萧子建、南郡王萧子夏等人，武帝的儿子建安王萧子真、巴陵王萧子伦等人。凡是高帝、武帝的子孙，无论年纪大小，都被杀害，前后一共有几十人。
巴陵王萧子伦当时只有十六岁，镇守琅琊。明帝派中书舍人茹法亮送毒酒给他。萧子伦整理好衣服帽子，出来接见茹
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