水疯狂涌入舰体，战舰迅速侧翻，倒扣在海面上，被困在船舱内的水兵绝望的呼救声被爆炸声淹没。第一波空袭持续了40分钟，珍珠港内已是一片火海，美军10艘战列舰有7艘被炸沉或重创，港口的防空体系陷入瘫痪。
而在大和号的指挥舱内，山本五十六面无表情地听着战报，当得知第一波空袭大获全胜时，他只是淡淡下令：“第二波空袭，即刻出发！目标，美军残存防空阵地与维修厂！”
8时40分，150架战机组成的第二波空袭梯队呼啸而至。此时的美军已经回过神来，残存的防空炮开始怒吼，却因缺乏统一指挥，火力稀疏而杂乱。零式战机在云层间灵活穿梭，不断击落升空的零星美军战机，俯冲轰炸机则对着防空炮位与指挥塔展开精准轰炸，一枚枚炸弹落下，将防空炮炸成废铁，指挥塔的玻璃被震得粉碎，通讯系统彻底中断。维修厂内，正在检修的美军舰艇被炸弹击中，燃起熊熊大火，船坞的钢架扭曲变形，沉入海底。第二波空袭的目的，是彻底摧毁美军的反击能力，为后续的毁灭性打击扫清障碍。
但山本五十六的野心远不止于此。他深知，战舰可以重建，战机可以补充，但燃油与后勤基地，才是太平洋舰队的命脉。“第三波空袭，目标，燃油储备库、兵营与医院！”
10时整，120架战机组成的第三波空袭梯队飞抵珍珠港。这支梯队携带的是燃烧弹与高爆弹，目标直指珍珠港西侧的燃油储备库——这里储存着美军太平洋舰队的全部燃油，足有450万桶。俯冲轰炸机投下的燃烧弹精准命中油罐，油罐瞬间爆炸，黑色的浓烟如同巨龙般直冲云霄，燃油流淌的地方，燃起数米高的火焰，将海面烤得滚烫，空气中弥漫着刺鼻的焦糊味。大火顺着油管蔓延，引燃了周边的仓库与兵营，兵营内的美军士兵来不及躲避，被炸得血肉横飞，医院的白色墙壁被鲜血染红，伤员与医护人员的惨叫声此起彼伏。原本救死扶伤的圣地，此刻沦为了人间炼狱。
美军的抵抗愈发微弱，不少士兵放下武器，躲在掩体后瑟瑟发抖。但山本五十六的指令依旧冰冷：“第四波空袭，清剿残余目标，务必将珍珠港彻底瘫痪！”
11时30分，100架战机组成的第四波空袭梯队抵达珍珠港。这一次，日军战机的目标是那些搁浅在浅滩的美军战舰、残存的码头设施与雷达站。俯冲轰炸机对着搁浅的战舰轮番轰炸，将其炸成一堆废铁；鱼雷攻击机则对着码头的栈桥发射鱼雷，栈桥轰然倒塌，港口的装卸设备化为齑粉；零式战机则低空扫射，将残存的
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